Dažniausiai klinikinio vaisto tyrimo užsakovas yra vaistus kurianti ir klinikinius tyrimus atliekanti, pelno siekianti farmacijos įmonė, kuri tyrėjams ir gydymo įstaigai, kurioje atliekamas tyrimas, skiria lėšų, reikalingų klinikiniam tyrimui atlikti.
Klinikinius vaistų tyrimus taip pat gali inicijuoti ir vykdyti mokslo institucijos (universitetai, institutai), o taip pat – atskiri tyrėjai. Taigi, užsakovu gali būti ne tik vaistus kurianti farmacinė kompanija, bet ir universitetas, ligoninė, visuomeninė mokslinė organizacija, kita ne pelno siekianti institucija, pacientų organizacija ar atskiras, nepriklausomas tyrėjas.
